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La collection

Par admin - Dernière modification 03/04/2017 14:18

Description

La collection est conservée en double,  une cryobanque étant située à Limoges, l'autre à Reims.
Les souches de Toxoplasma gondii sont obtenues par inoculation à la souris ou en culture cellulaire (THP1 ou VERO) à partir de prélèvements d’origine humaine (toxoplasmose congénitale, toxoplasmose de l’immunodéprimé, toxoplasmose acquise), ou animale.
La collection est constituée par les stocks de ces souches conservés en azote liquide (sous forme tachyzoïtes et/ou kystes).
 
Typage des souches de Toxoplasma gondii
 
La caractérisation génétique des souches fait appel à une méthode de haute résolution basée sur le polymorphisme de longueur de 15 marqueurs microsatellites (1).
En outre, 19 souches disponibles au catalogue du CRB ont fait l'objet d'un séquençage complet (2). L'appartenance à un haplogroupe a été défini par séquençage d'introns (3).

 

Souches catalogue séquencées

Cliquez sur lien suivant pour agrandir l'image: séquençage

Références bibliographiques :

  1. Ajzenberg D, Collinet F, Mercier A, Vignoles P, Dardé ML. Genotyping of Toxoplasma gondii isolates with 15 microsatellite markers in a single multiplex PCR assay. J Clin Microbiol. 2010 Dec ; 48 (12) : 4641-5. Epub 2010 Sep 29. PubMed : 20881166 ; PubMed Central : PMC3008440 
  2. Lorenzi H, Khan A, Behnke MS, Namasivayam S, Swapna LS, Hadjithomas M, Karamycheva S, Pinney D, Brunk BP, Ajioka JW, Ajzenberg D, Boothroyd JC, Boyle JP, Dardé ML, Diaz-Miranda MA, Dubey JP, Fritz HM, Gennari SM, Gregory BD, Kim K, Saeij JP, Su C, White MW, Zhu XQ, Rosenthal BM, Grigg ME, Parkinson J, Liu L, Kissinger JC, Roos DS, David Sibely L. Local admixture of amplified and diversified secreted pathogenesis determinants shapes mosaic Toxoplasma gondii genomes. Nat Commun. 2016 Jan 7; 7:10147. doi:10.1038/ncomms10147
  3. Su C, Khan A, Zhou P, Majumdar D, Ajzenberg D, Dardé ML, Zhu XQ, Ajioka JW, Rosenthal BM, Dubey JP, Sibley LD. Globally diverse Toxoplasma gondii isolates comprise six major clades originating from a small number of distinct ancestral lineages. Proc natl Acad Sci U S A. 2012 Apr 10; 109(15):5844-9. doi: 10.1073/pnas.1203190109

 

Conservation
 
Le stockage des souches en azote liquide est effectué en microtubes de 1,5 ml en MEM (ou RPMI)-10% SVF- 10% DMSO. Le nombre de tachyzoïtes ou de kystes dans chaque aliquote est indiqué.

 Contrôles qualité
 
La présence de Mycoplasma est sytématiquement  recherchée par PCR sur les cultures cellulaires.
Avant stockage, une vérification génotypique par analyse des microsatellites confrontée au résultat avant culture est effectuée sur chaque souche.
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